Агроэкология рассматривает сельскохозяйственное производство через призму экологических принципов, признавая биоразнообразие ценным производственным ресурсом, а не помехой. Разнообразие видов в агроэкосистеме обеспечивает устойчивость, снижает потребность во внешних ресурсах и повышает адаптивность к изменениям.
Функциональное биоразнообразие в агроэкосистеме включает хищных насекомых, контролирующих популяции вредителей; опылителей, обеспечивающих завязывание плодов; почвенные микроорганизмы, участвующие в цикле питательных веществ; и растения с разными корневыми системами, осваивающие разные горизонты почвы. Каждая функциональная группа организмов выполняет роль в экосистеме, которую без неё приходится заменять химическими или техническими средствами.
Практические приёмы повышения биоразнообразия в хозяйстве: создание полевых полос с дикой растительностью, оставление нераспаханных буферных зон вдоль водотоков, снижение пестицидной нагрузки и применение севооборотов с разнообразными культурами. Каждый из этих приёмов создаёт условия для восстановления и сохранения популяций полезных организмов. Агроэкологический подход не отрицает использования агрохимии, но рассматривает её как последнее, а не первое средство решения производственных задач.
