Переход к органическому зерновому производству — серьёзное стратегическое решение, требующее 2-3 лет подготовки до первой сертификации и прямых продаж с органической надбавкой. В переходный период хозяйство несёт дополнительные издержки на борьбу с сорняками и болезнями без привычного арсенала химических средств, не получая при этом органической ценовой премии.
Ключ к успешному переходу — наличие гарантированного рынка сбыта органического зерна ещё до начала перехода. Договор с переработчиком или торговой сетью, готовой платить надбавку за органику, кардинально меняет экономику перехода. В противном случае органически выращенное зерно продаётся по обычным ценам, что делает инвестиции в переход нерентабельными.
Агрономические трудности переходного периода решаемы при системном подходе. Сидеральные культуры восполняют дефицит азота. Механические обработки снижают семенной банк сорняков. Биологические препараты постепенно восстанавливают почвенную биоту. К концу третьего года большинство хозяйств отмечают, что земля стала «живее» — улучшилась структура почвы, повысилась её буферная ёмкость.